2020 eröffnet ein IntercityHotel am Hauptbahnhof von Flensburg. Das Haus wird nach dem Konzept des italienischen Architekten Matteo Thun eingerichtet, dessen Design auch in den IntercityHotels Braunschweig und Duisburg vorzufinden ist. Bei dem geplanten Hotel handelt es sich um einen Neubau, der in der Bahnhofstraße 40 entsteht. Es wird über 152 Zimmer, ein Restaurant, eine Bar, drei Konferenzräume und eine Tiefgarage verfügen. Das Haus wird über einen Pachtvertrag betrieben, Partner ist die JARA Grundstücksentwicklungsgesellschaft mbH.
An der deutsch-dänischen Grenze gelegen, ist Flensburg ein beliebtes Reiseziel für Touristen und Wochenendbesucher. Zur Ostseeküste sind es knapp vier, ins Nachbarland Dänemark zehn Kilometer. Von Flensburg aus besteht eine gute Bahnanbindung nach Kiel und Hamburg sowie ins dänische Fredericia. Die Stadt verfügt außerdem über einen Hafen, der vor allem für touristische Zwecke, Kreuzfahrten und den Fischmarkt genutzt wird. Das IntercityHotel Flensburg wird sowohl die Nachfrage von Freizeit- als auch Geschäftsreisenden bedienen.